More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0415 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  67.98 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  66.8 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  59.2 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  58.17 
 
 		 255 aa  306  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  48.61 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  49.4 
 
 		 257 aa  274  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  48.61 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  48.39 
 
 		 252 aa  271  5.000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  42.04 
 
 		 285 aa  229  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  43.03 
 
 		 263 aa  227  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  45.26 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 276 aa  102  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.98 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 316 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 285 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.44 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.44 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.62 
 
 		 370 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  25.19 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 291 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 309 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.2 
 
 		 371 aa  93.6  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.38 
 
 		 370 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.29 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 290 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 		 289 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  24.9 
 
 		 303 aa  92  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 315 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  25.94 
 
 		 278 aa  92  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 291 aa  91.3  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  23.83 
 
 		 308 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 		 290 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 282 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 339 aa  89.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  27.23 
 
 		 290 aa  88.6  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 294 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.79 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 292 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 298 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 289 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  25 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.86 
 
 		 288 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.79 
 
 		 368 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 283 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 299 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 284 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 246 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 340 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 290 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.4 
 
 		 368 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.03 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.81 
 
 		 331 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 340 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.6 
 
 		 372 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.51 
 
 		 275 aa  85.1  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  26.28 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.7 
 
 		 370 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  25.76 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  26.1 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  23.23 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.44 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  23.16 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.03 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  24.91 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>