More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0493 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  81.03 
 
 
291 aa  502  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  74.05 
 
 
292 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  73.87 
 
 
290 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  71.83 
 
 
288 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  64.48 
 
 
290 aa  422  1e-117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  65.16 
 
 
290 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
292 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
296 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3102  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.6937 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  29.85 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17861  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.32 
 
 
301 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0185  hypothetical protein  28.95 
 
 
303 aa  119  7e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2532  hypothetical protein  26.83 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.236123  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18081  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  29.1 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0155  hypothetical protein  27.88 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0704545  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  27.7 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17911  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  29.1 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.782041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
305 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
305 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4828  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.67 
 
 
301 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  27.86 
 
 
303 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
304 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
296 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.09 
 
 
303 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0013  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
300 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798898  normal  0.992459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
300 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
421 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
299 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
301 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
303 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.39 
 
 
297 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
314 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
312 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1726  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
303 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.35 
 
 
331 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17211  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  27.4 
 
 
314 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.951969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  28.33 
 
 
330 aa  100  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  29.17 
 
 
318 aa  99.8  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  29.89 
 
 
272 aa  99.4  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25921  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  25.85 
 
 
319 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28.43 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1252  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.8 
 
 
316 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.261139  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
280 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  27.68 
 
 
314 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  27.63 
 
 
323 aa  90.1  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  25.08 
 
 
300 aa  90.1  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13301  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.12 
 
 
313 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  25.55 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.07 
 
 
368 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
327 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
274 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0442  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
334 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.49 
 
 
368 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  25.59 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_4818  predicted protein  25.18 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
281 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1206  putative alpha/beta hydrolase superfamily  23.69 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20811  alpha/beta fold family hydrolase  23.69 
 
 
299 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.509173  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  26.47 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
276 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
253 aa  85.9  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  25.18 
 
 
281 aa  85.9  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  25.26 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  24.83 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.71 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.27 
 
 
370 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.32 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.24 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  25.37 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.17 
 
 
335 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13451  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.45 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
329 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.95 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.02 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.23 
 
 
369 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  25.25 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13201  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25.33 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  24.81 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>