More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42230 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  100 
 
 
271 aa  548  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  74.63 
 
 
273 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  57.99 
 
 
282 aa  311  5.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  47.39 
 
 
279 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  46.27 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  48.88 
 
 
275 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  45.72 
 
 
273 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  46.1 
 
 
304 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
278 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  45.19 
 
 
278 aa  244  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  45.32 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  46.47 
 
 
276 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  44.78 
 
 
274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  46.38 
 
 
291 aa  237  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 
289 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  45.38 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  45.38 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 
283 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
283 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  38.2 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 
283 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  39.63 
 
 
282 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 
288 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  37.04 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  37.09 
 
 
277 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  39.05 
 
 
289 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.15 
 
 
288 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 
279 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
295 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  35.71 
 
 
291 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 
285 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
289 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
291 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
298 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  34.34 
 
 
289 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
290 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
287 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  34.32 
 
 
288 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 
302 aa  148  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.92 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.92 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.92 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.92 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  33.92 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  33.92 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 
286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  36.6 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
287 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
285 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  32.21 
 
 
285 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
284 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
293 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
298 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
282 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 
279 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
286 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
279 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
285 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
282 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
293 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
345 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
278 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 
278 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
271 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  31.37 
 
 
287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
274 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.9 
 
 
285 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
290 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
315 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
296 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
286 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.23 
 
 
263 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
304 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3771  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
282 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3844  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
282 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
288 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
287 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.89 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>