More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5690 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  83.75 
 
 
283 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  83.75 
 
 
283 aa  494  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  76.1 
 
 
289 aa  414  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  70.23 
 
 
278 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  71.84 
 
 
283 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  73.28 
 
 
274 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  70.11 
 
 
291 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  67.4 
 
 
286 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  67.17 
 
 
304 aa  361  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  64.42 
 
 
276 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  66.92 
 
 
276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  66.8 
 
 
275 aa  348  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  63.02 
 
 
273 aa  344  8.999999999999999e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  57.95 
 
 
279 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  55.89 
 
 
278 aa  310  1e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  52.51 
 
 
288 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  49.11 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
283 aa  256  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  45.49 
 
 
271 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
273 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  46.18 
 
 
282 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 
279 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.46 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
302 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 
291 aa  159  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 
279 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 
282 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
289 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  34.04 
 
 
289 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  37.08 
 
 
288 aa  149  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
277 aa  148  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
286 aa  148  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
288 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
289 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 
288 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
294 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  34.7 
 
 
289 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  35.51 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
285 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
290 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.7 
 
 
288 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.59 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
288 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 
295 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.59 
 
 
293 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  34.59 
 
 
293 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.59 
 
 
293 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.59 
 
 
293 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.59 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
298 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 
293 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
285 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  34.08 
 
 
286 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
291 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
283 aa  126  5e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  34.95 
 
 
287 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
285 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
297 aa  122  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
290 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
278 aa  116  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  30.22 
 
 
278 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
296 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
315 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 
314 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
271 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
274 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
312 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
308 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2414  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
276 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0107597  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.18 
 
 
285 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
350 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3783  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.106852  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
361 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
287 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 
279 aa  95.9  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
301 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>