More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4621 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  83.58 
 
 		 283 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  77.21 
 
 		 289 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  70.99 
 
 		 278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  70.96 
 
 		 283 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  72.59 
 
 		 274 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  69.5 
 
 		 291 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  67.5 
 
 		 286 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  65.66 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  66.17 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  61.15 
 
 		 276 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  66.8 
 
 		 275 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  59.62 
 
 		 273 aa  339  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  56.27 
 
 		 278 aa  318  6e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  55.85 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  49.62 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  47.31 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  51.89 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  44.19 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  43.68 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 		 279 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  37.89 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 277 aa  155  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  34.63 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  36.04 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  36.1 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.99 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  34.95 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 289 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 286 aa  146  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.87 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  34.35 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  32.75 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  32.75 
 
 		 293 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 285 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 294 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  34.31 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 289 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 		 298 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 		 283 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  31.23 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  32.29 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  31.44 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.85 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 361 aa  108  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 312 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.12 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.89 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>