More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3344 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  77.54 
 
 		 283 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  77.21 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  77.21 
 
 		 283 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  73.12 
 
 		 291 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  74.28 
 
 		 274 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  67.84 
 
 		 278 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  68.68 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  76.23 
 
 		 283 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  68.01 
 
 		 304 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  62.72 
 
 		 276 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  67.78 
 
 		 275 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  66.18 
 
 		 276 aa  362  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  60.95 
 
 		 273 aa  355  5e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  59.29 
 
 		 279 aa  347  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  57.86 
 
 		 288 aa  347  1e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  55.23 
 
 		 278 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  47.99 
 
 		 282 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  43.07 
 
 		 273 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  47.62 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  43.96 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 282 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 286 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  34.71 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 289 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.56 
 
 		 283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  34.7 
 
 		 285 aa  145  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.71 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.81 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.52 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  35.66 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  34.71 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  34.71 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 287 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  139  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  32.61 
 
 		 299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 		 285 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  34.63 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 290 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  33.89 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  31.78 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.07 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4238  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.919736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.82 
 
 		 285 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 		 312 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.62 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 361 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  31.3 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>