More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1553 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
286 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  63.83 
 
 
285 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 
290 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 
292 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 
302 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
279 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4466  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.911408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
289 aa  116  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
345 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
284 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 
284 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  31.54 
 
 
289 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
276 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
283 aa  105  7e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
339 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
282 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
283 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
289 aa  103  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
283 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
315 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
361 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  32.88 
 
 
286 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
274 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.58 
 
 
293 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
288 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
290 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  30.58 
 
 
293 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.58 
 
 
293 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.58 
 
 
293 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.58 
 
 
288 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.23 
 
 
453 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
298 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.58 
 
 
288 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 
293 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
281 aa  100  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  27.64 
 
 
275 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.95 
 
 
291 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
273 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
291 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.45 
 
 
456 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
350 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 
298 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30.28 
 
 
341 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
287 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.66 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
271 aa  99.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
286 aa  99  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
304 aa  99.4  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
283 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  28.83 
 
 
278 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
288 aa  98.6  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.17 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
340 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
275 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.35 
 
 
462 aa  95.9  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.14 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
333 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
504 aa  95.5  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.15 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.8 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  27.65 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
287 aa  92.8  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
437 aa  92.8  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
285 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
288 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
302 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>