More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2629 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
263 aa  511  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  46.36 
 
 
264 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  45.32 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
271 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
273 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.9 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
278 aa  99.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
259 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.14 
 
 
257 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
273 aa  95.9  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  30.77 
 
 
259 aa  95.5  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.4 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
271 aa  94  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  30.62 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  30.23 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.22 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
278 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  32.83 
 
 
268 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3242  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
268 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.988138  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.87 
 
 
283 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.53 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
291 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 
275 aa  89.4  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
288 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
397 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  28.78 
 
 
314 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
264 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
264 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  29.48 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.57 
 
 
331 aa  86.7  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
277 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
309 aa  85.9  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
265 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.64 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  23.14 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.97 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  34.94 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  32.39 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.9 
 
 
263 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3121  transcriptional regulator, CadC  30.36 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116051  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.87 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.82 
 
 
289 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
269 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
316 aa  82  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.55 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.52 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
273 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.84 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>