More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3352 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  100 
 
 		 314 aa  648    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 294 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  42.6 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.28 
 
 		 265 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.66 
 
 		 279 aa  97.4  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 		 267 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 268 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 278 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.36 
 
 		 270 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 289 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 263 aa  89  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  23.44 
 
 		 270 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.81 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  23.44 
 
 		 270 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 284 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2527  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 264 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  23.79 
 
 		 270 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.45 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  26.87 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  24.09 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  23.44 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  23.44 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.89 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  23.44 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  28.14 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.09 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.37 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  28.26 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.36 
 
 		 262 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  26.81 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  26.81 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  26.81 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  27.65 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  26.45 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 		 425 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 		 292 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.86 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.63 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.1 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.47 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  23.73 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  24.44 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0650  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477317  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  22.01 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  28.73 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  26.09 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.78 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  25.37 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>