More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4078 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 267 aa  557  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  67.68 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  62.74 
 
 		 263 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  63.16 
 
 		 268 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  63.88 
 
 		 264 aa  360  9e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  59.92 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  59.92 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  60.82 
 
 		 272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  58.87 
 
 		 288 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  54.02 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  57.63 
 
 		 267 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  56.49 
 
 		 268 aa  311  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  55.3 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  53.82 
 
 		 266 aa  309  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  56.27 
 
 		 269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  52.09 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  52.26 
 
 		 273 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  50.75 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  55.09 
 
 		 266 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  55.09 
 
 		 266 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  55.09 
 
 		 266 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  53.38 
 
 		 274 aa  294  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  52.26 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  46.36 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  48.11 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  44.03 
 
 		 245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 287 aa  241  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  47.73 
 
 		 282 aa  234  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  24.12 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.57 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  25.37 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  26.17 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  25.2 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  24.21 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25.28 
 
 		 387 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 		 281 aa  72  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  23.17 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  24.53 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  23.17 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  23.51 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.8 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  22.5 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  26.94 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.4 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.19 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.05 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.73 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  21.6 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  24.43 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  22.64 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  22.92 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.57 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  21.98 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  25.48 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  23.94 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  23.94 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  21.46 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  22.35 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  22.98 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  26.09 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  24.59 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  25.29 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  22.14 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  21.43 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  23.55 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  23.81 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25.76 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>