More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1735 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1735  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 260 aa  510  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  94.23 
 
 		 260 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  91.15 
 
 		 260 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1581  alpha/beta hydrolase fold  74.8 
 
 		 259 aa  362  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  55.08 
 
 		 266 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  50.98 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  50.59 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  50.39 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  49.79 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  41.31 
 
 		 278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01012  predicted hydrolase  43.16 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2633  alpha/beta hydrolase  43.16 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.96339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01019  hypothetical protein  43.16 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1246  putative rutD protein  43.16 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2116  putative rutD protein  43.16 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1124  putative rutD protein  43.16 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2586  alpha/beta hydrolase fold  43.16 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0660312 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1522  alpha/beta hydrolase fold  41.15 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.401637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1127  putative rutD protein  42.31 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  34.11 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  32.43 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.37 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.32 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.45 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.56 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.69 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  35.27 
 
 		 393 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.62 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  32.31 
 
 		 261 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  35.02 
 
 		 391 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 267 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1265  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 267 aa  95.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.9 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.07 
 
 		 373 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.64 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.66 
 
 		 425 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  28.52 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 289 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.38 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  32.16 
 
 		 265 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  33.21 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  32.53 
 
 		 278 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3040  3-oxoadipate enol-lactonase  29.53 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  31.3 
 
 		 265 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  30.5 
 
 		 260 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.18 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2294  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.610151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.96 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 360 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  30.08 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.79 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 		 259 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.81 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 283 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 		 283 aa  85.1  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  31.52 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.59 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.13 
 
 		 275 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  32.93 
 
 		 279 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  27.53 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.12 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  31.03 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  27.06 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>