More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0780 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 276 aa  576  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  64.71 
 
 		 270 aa  357  8e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  54.95 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  51.81 
 
 		 273 aa  275  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  39.19 
 
 		 271 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 266 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  28.89 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  31.14 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  28.68 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.86 
 
 		 425 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4169  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.09 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  30.13 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.15 
 
 		 270 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.08 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.81 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 270 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  27.96 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.12 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  28.21 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  30.4 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.49 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.74 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.3 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  27.47 
 
 		 258 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.27 
 
 		 261 aa  105  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 276 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 		 270 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 276 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.58 
 
 		 256 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.7 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  25.9 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  26.61 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  29.78 
 
 		 393 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.7 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 275 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  31.48 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  28.86 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.99 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  27.02 
 
 		 373 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.78 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  28.1 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  29.2 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.17 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.88 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  28.57 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.17 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  26.48 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  29.1 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  29.29 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.75 
 
 		 259 aa  99.8  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>