More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1968 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
259 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  45.56 
 
 
269 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  44.05 
 
 
275 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 
280 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  35.89 
 
 
277 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  39.11 
 
 
277 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  38.71 
 
 
277 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  38.93 
 
 
292 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  34.68 
 
 
282 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  35.89 
 
 
277 aa  155  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 
282 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  33.59 
 
 
282 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  33.07 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 
279 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
262 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 
279 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
265 aa  135  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.58 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  33.07 
 
 
393 aa  129  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  34.11 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  32.3 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.56 
 
 
373 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  35.25 
 
 
246 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
272 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  35.14 
 
 
263 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  30.8 
 
 
425 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 
260 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.79 
 
 
393 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  31.8 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  31.38 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  31.38 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  31.38 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.94 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  29.7 
 
 
278 aa  119  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 
260 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.31 
 
 
263 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  30.68 
 
 
260 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  30.27 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  31.35 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  32.14 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  33.04 
 
 
259 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
262 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  31.51 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.06 
 
 
263 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  27.62 
 
 
380 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.42 
 
 
392 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.78 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  27.82 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  32.08 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  31.8 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  31.95 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.71 
 
 
251 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 
396 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  31.2 
 
 
266 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
267 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
285 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  27.49 
 
 
255 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
360 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  30 
 
 
261 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  28.85 
 
 
264 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
261 aa  105  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
263 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  27.95 
 
 
269 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 
271 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
377 aa  104  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  31.23 
 
 
262 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
263 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
265 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  28.08 
 
 
263 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  26.34 
 
 
275 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  30.83 
 
 
262 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.38 
 
 
261 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.08 
 
 
263 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
281 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  33.2 
 
 
265 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 
263 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02840  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.31 
 
 
263 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
260 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  26.48 
 
 
261 aa  102  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
316 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.06 
 
 
264 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  30.92 
 
 
265 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
263 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  29.44 
 
 
281 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 
261 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>