More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1644 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 318 aa  667    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0919  alpha/beta hydrolase fold  75.24 
 
 		 320 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.495242  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2097  alpha/beta hydrolase fold  73.55 
 
 		 324 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  68.81 
 
 		 320 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1643  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 		 298 aa  401  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1567  alpha/beta hydrolase fold  56.21 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0838089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  41.86 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 266 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  24.09 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.2 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  24.07 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  27.49 
 
 		 294 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 273 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  27.24 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 		 304 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 309 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  23.05 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  23.05 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  23.59 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  23.05 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.31 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  25.63 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  23.68 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.77 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.35 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  24.38 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 263 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  23.19 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.41 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  24.68 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.11 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  24.43 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.1 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  24.15 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  23.64 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1701  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.33 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0186237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1729  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.33 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1745  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.33 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  22.06 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1679  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.33 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0527  4-carboxymuconolactone decarboxylase  24.33 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1450  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  22.06 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  23.89 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.88 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  25.57 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  23.64 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.18 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  23.05 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>