More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2528 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
301 aa  620  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  76.41 
 
 
302 aa  494  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  68.93 
 
 
298 aa  415  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  67.15 
 
 
297 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  60.29 
 
 
299 aa  373  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  52.58 
 
 
295 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  53.41 
 
 
296 aa  309  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.55 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
345 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 
330 aa  102  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
325 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
284 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  27.59 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
332 aa  95.5  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
332 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
354 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
332 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  28.77 
 
 
291 aa  94  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
296 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
339 aa  93.2  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
332 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
308 aa  92.8  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  25.99 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 
312 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
275 aa  90.1  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.65 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
297 aa  89  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
312 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
312 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  28.62 
 
 
453 aa  87  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
278 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.96 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.71 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
290 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.46 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  24.73 
 
 
456 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  25.78 
 
 
279 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  26.78 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  26.44 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25.71 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1641  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
317 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.24202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3935  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2989  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.720192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.23 
 
 
462 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
274 aa  79  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3642  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20936  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2720  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  26.47 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  26.74 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.69 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.3 
 
 
372 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.18 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  27.54 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0011  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase)  27.5 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.903743  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
278 aa  77  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
282 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>