More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1604 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  100 
 
 		 273 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  86.35 
 
 		 273 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  60.38 
 
 		 267 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  58.96 
 
 		 269 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  60.23 
 
 		 267 aa  338  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  57.58 
 
 		 267 aa  329  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  52.85 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  52.09 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  52.65 
 
 		 263 aa  294  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  53.03 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  46.21 
 
 		 269 aa  272  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 		 266 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  49.43 
 
 		 288 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  48.68 
 
 		 268 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  48.11 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  48.68 
 
 		 272 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  49.63 
 
 		 276 aa  261  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  48.12 
 
 		 274 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  48.12 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  44.91 
 
 		 270 aa  248  8e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  44.27 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 287 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  45.53 
 
 		 245 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  42.64 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  38.35 
 
 		 270 aa  204  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  40.3 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  38.7 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  41.47 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  22.99 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  23.31 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.27 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.27 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.27 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.27 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.32 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  26.22 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  22.75 
 
 		 425 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  22.9 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  24.22 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  22.63 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  22.52 
 
 		 462 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 315 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.42 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  24.7 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  25.81 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.4 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3235  magnesium chelatase accessory protein  25.59 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  23.85 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  24.25 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.79 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0348  magnesium chelatase accessory protein  40.59 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  23.53 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.07 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  42.57 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.75 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  22.85 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.03 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  24.25 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  21.27 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>