More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5274 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 
270 aa  237  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  44.27 
 
 
288 aa  225  7e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 
270 aa  221  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 
266 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  40.68 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  43.67 
 
 
268 aa  215  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
263 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 
266 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 
266 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  40.16 
 
 
268 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 
266 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 
267 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 
267 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 
272 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
268 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 
273 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 
281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  35.52 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 
274 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  38.7 
 
 
273 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 
267 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
282 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
269 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  34.46 
 
 
287 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
267 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  36.13 
 
 
245 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  27.48 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  25.5 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  28.98 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  26.02 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
268 aa  79  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.24 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  27.67 
 
 
255 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.56 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  27.67 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.75 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  26.88 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  24.7 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.86 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  28.51 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  26.83 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  26.83 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  26.83 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.03 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  26.85 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  25.3 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
259 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.76 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  22.76 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.45 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  24.9 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.32 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  26.51 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  26.67 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  25.95 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.31 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.78 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  26.98 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  25.77 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  25.49 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  27.95 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
350 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  23.51 
 
 
257 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  28.24 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>