More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5821 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  40.15 
 
 		 263 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 		 276 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 274 aa  218  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  38.49 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 268 aa  215  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 270 aa  215  8e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  36.98 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  38.64 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  36.23 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  38.35 
 
 		 273 aa  204  9e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  35.98 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 272 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 268 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  32.83 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  37.7 
 
 		 245 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.15 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  24.71 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.38 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  24.23 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.98 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  25 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  29.15 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  23.98 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  25.67 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25.95 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  21.46 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  23.6 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  22.8 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  23.29 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  24.03 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.98 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  22.67 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  26.98 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  25.1 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  27.34 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.62 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  23.35 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.24 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  23.35 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  21.13 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.8 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  22.75 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  19.69 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3157  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  22.78 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  20.46 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  23.51 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  22.74 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  24.88 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  24.41 
 
 		 397 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5093  transcriptional regulator, SARP family  26.75 
 
 		 516 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.093357  normal  0.464925 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  22.7 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  23.05 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  23.44 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  20.97 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  20.73 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  20.56 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  22.96 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>