More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2309 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  53.03 
 
 		 263 aa  305  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  53.03 
 
 		 268 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  50.75 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  51.32 
 
 		 264 aa  288  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  51.71 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  51.13 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  49.25 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  47.91 
 
 		 263 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 269 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  48.3 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  48.85 
 
 		 268 aa  274  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  50.38 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  46.79 
 
 		 267 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  46.97 
 
 		 267 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  46.62 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  44.4 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 		 266 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 		 266 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 		 266 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  47.76 
 
 		 245 aa  255  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  44.89 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  44.91 
 
 		 273 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  43.61 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  42.97 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  41.98 
 
 		 281 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 		 270 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 282 aa  185  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.5 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25.18 
 
 		 387 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  24.12 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  22.96 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.88 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  21.62 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  23.72 
 
 		 453 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 		 387 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25.64 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  23.14 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  23.28 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.85 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.19 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  21.62 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.27 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  21.92 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  24.58 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  25.31 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  21.54 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  24.81 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  23.9 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  23.9 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  22.39 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.73 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  23.48 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  24.1 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  25 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  24.61 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  23.48 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  22.71 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  24.91 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>