More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3851 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  67.3 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  69.2 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  63.5 
 
 		 263 aa  349  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  65.66 
 
 		 268 aa  348  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  64.64 
 
 		 288 aa  344  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  60.82 
 
 		 267 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 		 268 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  58.49 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  64.5 
 
 		 266 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  64.5 
 
 		 266 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  64.5 
 
 		 266 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  56.87 
 
 		 266 aa  321  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  57.41 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  56.72 
 
 		 276 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  55.77 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  55.38 
 
 		 274 aa  294  9e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  56.06 
 
 		 267 aa  291  6e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  51.14 
 
 		 269 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  48.3 
 
 		 270 aa  275  7e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  48.68 
 
 		 273 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  48.12 
 
 		 273 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  45.28 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  51.87 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  45.35 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  46.53 
 
 		 245 aa  246  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  51.34 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  42.08 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 270 aa  198  9e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  40.91 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.23 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.31 
 
 		 425 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  32.28 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.92 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.57 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  26.64 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.09 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.6 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.77 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.78 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.78 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.52 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.96 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.08 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.33 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.13 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.21 
 
 		 258 aa  72  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.31 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  27.27 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.81 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  27.14 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  24.02 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  24.33 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.8 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  26.67 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.09 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  30.99 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  30.99 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  28.11 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  23.46 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>