More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01668 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  100 
 
 		 245 aa  510  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  61.48 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  55.56 
 
 		 287 aa  298  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 		 267 aa  292  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  48.97 
 
 		 263 aa  265  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  48.35 
 
 		 288 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  47.76 
 
 		 270 aa  255  4e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  48.72 
 
 		 267 aa  252  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  47.44 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  46.53 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  50.85 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  47.33 
 
 		 268 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 263 aa  244  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  45.31 
 
 		 268 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  44.03 
 
 		 267 aa  243  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  46.58 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  50.85 
 
 		 274 aa  242  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  46.91 
 
 		 264 aa  238  5.999999999999999e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  43.03 
 
 		 266 aa  235  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  45.42 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  47.66 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  45.49 
 
 		 266 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  45.49 
 
 		 266 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  45.49 
 
 		 266 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  43.21 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  45.53 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  43.5 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  43.59 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  41.45 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.23 
 
 		 265 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  24.05 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  24.52 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.81 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  23.18 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  25.93 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  22.55 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  24.32 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 		 271 aa  72  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  22.62 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  22.04 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  24.57 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  23.43 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  20.99 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  24.49 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  23.65 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  23.46 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  23.6 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.52 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  25.7 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.02 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.02 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.02 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  24.3 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  23.5 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  23.75 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.02 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  22.94 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  23.62 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  21.72 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  22.88 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.61 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  22 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 278 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  26.91 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>