More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2892 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  69.96 
 
 
266 aa  378  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  67.68 
 
 
268 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  67.55 
 
 
288 aa  362  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  64.5 
 
 
272 aa  349  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  62.6 
 
 
264 aa  332  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  57.63 
 
 
263 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 
267 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  57.63 
 
 
267 aa  319  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  55.34 
 
 
268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  55.73 
 
 
267 aa  304  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  55.3 
 
 
263 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  54.58 
 
 
267 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  52.67 
 
 
276 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  53.05 
 
 
274 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  51.91 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 
269 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  53.79 
 
 
273 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  52.81 
 
 
273 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  47.91 
 
 
269 aa  275  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 
270 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  47.15 
 
 
268 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  45.49 
 
 
245 aa  246  3e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  48.64 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
287 aa  236  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 
282 aa  236  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  44.62 
 
 
268 aa  211  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.36 
 
 
270 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.89 
 
 
271 aa  94  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  24.42 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
271 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  25.3 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.66 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.89 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  23.35 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  25.78 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  23.44 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.02 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.7 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.7 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.7 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
257 aa  72  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.7 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  24.9 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.02 
 
 
425 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
266 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  25.68 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.48 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0712  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  25.1 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  25.59 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.59 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  25.59 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.9 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  26.67 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.38 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.39 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  25.1 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  25.3 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.7 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.97 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  25.48 
 
 
279 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  26.81 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  26.1 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.026043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>