More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6302 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
266 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  33.46 
 
 
267 aa  160  2e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2427  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
267 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0741  alpha/beta fold family hydrolase  35.85 
 
 
263 aa  155  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00132598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  32.45 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1280  alpha/beta fold family hydrolase  30.15 
 
 
258 aa  122  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000022197  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  28.2 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2340  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.304553  normal  0.102519 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
266 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
266 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  27.31 
 
 
270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.78 
 
 
273 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 
273 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  29.23 
 
 
273 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
277 aa  105  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3584  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
274 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3239  chloride peroxidase  29.29 
 
 
273 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.826064  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  31 
 
 
274 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 
303 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 
274 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
271 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  41.22 
 
 
273 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3146  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
274 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351869  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
273 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
273 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
271 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  40 
 
 
273 aa  99.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1046  alpha/beta hydrolase fold protein  29.08 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
274 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
275 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  27.5 
 
 
274 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  27.5 
 
 
274 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
273 aa  98.6  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.3 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  43.41 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  40.77 
 
 
322 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.76 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  40.6 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 
324 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
324 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3914  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 
273 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.732284  normal  0.454673 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 
276 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
277 aa  95.9  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  25.72 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  29.6 
 
 
276 aa  95.9  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
294 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
334 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
273 aa  95.1  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  30.09 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1113  Chloride peroxidase  41.67 
 
 
324 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3362  alpha/beta hydrolase fold  40.31 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351371  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
273 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4668  non-heme chloroperoxidase  40.91 
 
 
276 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2363  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
328 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.329927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3581  Alpha/beta hydrolase  38.76 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2950  putative hydrolase signal peptide protein  25.53 
 
 
315 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
273 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0442  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
326 aa  92.8  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  41.44 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
273 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  42.97 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  40.32 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4420  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
274 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 
330 aa  92  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5825  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
276 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0224159  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
342 aa  92  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  25.75 
 
 
277 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
278 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5112  non-heme haloperoxidase  37.59 
 
 
395 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  28.37 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
277 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  24.81 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  26.01 
 
 
290 aa  90.1  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  27.11 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 
273 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1889  non-heme chloroperoxidase  41.09 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108181  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  38.06 
 
 
343 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 
279 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>