More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0236 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  100 
 
 		 261 aa  533  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  78.57 
 
 		 259 aa  411  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  73.41 
 
 		 255 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  71.03 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  64.31 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  63.97 
 
 		 256 aa  342  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  63.97 
 
 		 256 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  63.97 
 
 		 256 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  63.97 
 
 		 256 aa  340  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  61.72 
 
 		 256 aa  340  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  63.49 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  63.49 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  63.49 
 
 		 258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  61.33 
 
 		 256 aa  338  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  61.33 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  61.33 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  61.33 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  61.33 
 
 		 256 aa  338  7e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  61.33 
 
 		 256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  61.33 
 
 		 256 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  60.94 
 
 		 256 aa  332  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  61.09 
 
 		 257 aa  325  6e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  63.64 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  55.38 
 
 		 261 aa  282  5.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  51.98 
 
 		 254 aa  258  9e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  50.8 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  46.25 
 
 		 268 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  45.49 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  46.4 
 
 		 259 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  45.7 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  46.25 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  46.56 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  44.53 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  40.75 
 
 		 268 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  46.56 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  42.64 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  44.96 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  45.6 
 
 		 264 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  41.86 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  42.26 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  46.58 
 
 		 240 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  45.49 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  36.65 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  46.41 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  41.08 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  41.7 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  43.44 
 
 		 230 aa  188  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  44.81 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  36.9 
 
 		 273 aa  172  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  38.46 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  40.33 
 
 		 275 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  37.98 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  34.26 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  33.86 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  38.91 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  38.4 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  37.74 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  39.75 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  37.65 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39.24 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  39.91 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  39.91 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  31.62 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  31.43 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  29.05 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  29.05 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  30.58 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  31.3 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  31.4 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.15 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.33 
 
 		 558 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.52 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.21 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  30.45 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  27.92 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  30.04 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  29.22 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  25.62 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  25.62 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  25.62 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  25.62 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  25.62 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  28.33 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.54 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  27.13 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  27.92 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  27.41 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  30.67 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  28.17 
 
 		 425 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>