130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5174 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 243 aa  472  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  75.31 
 
 		 243 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  74.9 
 
 		 243 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  61.73 
 
 		 243 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  60.91 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  61.32 
 
 		 243 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  60.08 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  60.08 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  59.26 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  55.83 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  52.07 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  35.06 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  32.26 
 
 		 267 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  33.33 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  32.24 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  31.28 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  30.58 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  31.12 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  33.48 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.79 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  33.92 
 
 		 256 aa  101  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  31.43 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  31.02 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  31.43 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  33.47 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  33.74 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  32.91 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  32.91 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  32.91 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  32.5 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  32.91 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  32.91 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  32.91 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  32.66 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  33.05 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  31.84 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  31.84 
 
 		 264 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  32.93 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  32.93 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  32.93 
 
 		 256 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  32.37 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  32.52 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  31.84 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  31.33 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  31.33 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  32.63 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  31.33 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  32.49 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  31.67 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  31.43 
 
 		 259 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  31.95 
 
 		 255 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  31.19 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  32.38 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  33.33 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.02 
 
 		 558 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  30.77 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  30.8 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  29.2 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  29.2 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  28.38 
 
 		 258 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  34.3 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  30.92 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.14 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  32.44 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  28.75 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  28.05 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  30.17 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.11 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  31.43 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  30.74 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  31.43 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  33.33 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 253 aa  72  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.87 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  32.2 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  22.67 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  34.83 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.22 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  27.87 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  27.87 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  28.57 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0961  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0214674  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 		 301 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.59 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  20.75 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.54 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  26.53 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4186  bioH protein, putative  23.11 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  22.22 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  22.22 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  28.92 
 
 		 301 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  20.33 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  28.92 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 		 271 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  21.16 
 
 		 246 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>