232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4086 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  100 
 
 		 241 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  61.44 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  53.31 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  53.72 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  48.76 
 
 		 243 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  49.59 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  49.17 
 
 		 243 aa  208  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  47.52 
 
 		 243 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  50.83 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  50.83 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  33.33 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  31.95 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  31.95 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  31.95 
 
 		 258 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  33.89 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  32.64 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  33.47 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  30.71 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  32.61 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  31.4 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  29.96 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  29.17 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.54 
 
 		 558 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  33.06 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  31.36 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  31.36 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.17 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.92 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  32.39 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  31.36 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  31.36 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  31.36 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  30.96 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  30.93 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  32.07 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  31.36 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  31.03 
 
 		 264 aa  99  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  30.42 
 
 		 264 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  30.42 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  34.47 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  31.3 
 
 		 264 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  26.69 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  30.93 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  28.45 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  31.69 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  30.51 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  33.19 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  30.8 
 
 		 255 aa  95.9  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  26.27 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  30.25 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  31.22 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  31.22 
 
 		 256 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  36.59 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  31.22 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  37.2 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  30.87 
 
 		 266 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  33.33 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  28.94 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  31.6 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  29.24 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  27.95 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  33 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  29.55 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  29.39 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  27.2 
 
 		 259 aa  89  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  26.72 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  32.59 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  30.77 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  30 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  27.35 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  26.52 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  30.13 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  34.02 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0961  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0214674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  23.65 
 
 		 238 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  26.61 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  21.1 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  21.1 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  27.19 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1010  putative bioH protein  22.82 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  22.22 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  22.98 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2305  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  26.7 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  27.46 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  25.14 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0023  pimeloyl-CoA synthesis (biotin biosynthesis)  22 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00488591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  21.95 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  24.32 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1165  alpha/beta hydrolase  34.04 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>