126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_06530 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  100 
 
 		 240 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  97.92 
 
 		 240 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  62.4 
 
 		 243 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  60.49 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  59.26 
 
 		 243 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  55.97 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  54.73 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  53.91 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  52.67 
 
 		 243 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  52.92 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  50.83 
 
 		 241 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  34.24 
 
 		 267 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  30.74 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  30.74 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  30.74 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  32.51 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  32.1 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  33.5 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  32.1 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  31.19 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  31.15 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  31.97 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  29.58 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  27.2 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  31.68 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  33.17 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  33.17 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  33.17 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  33.17 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  32.16 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  32.16 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  32.16 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  31.2 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  31.3 
 
 		 558 aa  93.2  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  31.2 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  31.2 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  31.2 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  31.2 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  30.42 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  33 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  31.2 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  32.84 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  32 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  32.37 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  31.5 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  29.88 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  33.47 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  31.12 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  28.81 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  34.02 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  30.04 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  29.31 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  31.5 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  30.25 
 
 		 260 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  30.33 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  27.35 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  30.04 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  29.39 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  27.94 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  28.93 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  26.86 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  33.2 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  29.39 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  29.67 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  27.98 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  32.92 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  26.7 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  26.7 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  26.09 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  29.58 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.9 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  28.74 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  28.74 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  31.4 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  32.23 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  28.37 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.26 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  33.47 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  23.05 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  25.51 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  25.51 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  27.4 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0961  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0214674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.91 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 		 270 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  22.66 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  26.67 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  26.73 
 
 		 273 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  24.22 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4227  putative bioH protein  21.37 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  25.66 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>