More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1430 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  98.33 
 
 
239 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  37.85 
 
 
261 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  37.24 
 
 
255 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  33.33 
 
 
254 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  35.15 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  34.13 
 
 
259 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  36.44 
 
 
256 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  36.44 
 
 
256 aa  161  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  35.15 
 
 
255 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  35.63 
 
 
256 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  34.26 
 
 
261 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  34.25 
 
 
255 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  35.63 
 
 
256 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  35.63 
 
 
256 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  35.63 
 
 
256 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  35.63 
 
 
256 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  33.47 
 
 
261 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  34.29 
 
 
258 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  34.29 
 
 
258 aa  158  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  34.29 
 
 
258 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  35.63 
 
 
256 aa  158  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  35.06 
 
 
264 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  35.12 
 
 
255 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  35.83 
 
 
268 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  34.66 
 
 
260 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  35.06 
 
 
256 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  32.94 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  33.48 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  36.4 
 
 
256 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  35.08 
 
 
258 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  34.62 
 
 
257 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  34.41 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  34.41 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  34.41 
 
 
256 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  34.41 
 
 
256 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  31.2 
 
 
268 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  33.91 
 
 
240 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  32.24 
 
 
259 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  33.74 
 
 
264 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  31.52 
 
 
266 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  33.33 
 
 
264 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  33.33 
 
 
264 aa  141  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  33.33 
 
 
264 aa  141  9e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  33.74 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  33.47 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  32.79 
 
 
273 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  28.57 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  30 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  31.89 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  32.14 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  32.33 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  31.9 
 
 
240 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  32.64 
 
 
247 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  36.36 
 
 
253 aa  121  8e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  32.31 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  32.55 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  27.24 
 
 
255 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  34.45 
 
 
234 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  34.45 
 
 
234 aa  111  9e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  27.24 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  27.67 
 
 
259 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  31.35 
 
 
254 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  31.35 
 
 
254 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  28.33 
 
 
243 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
277 aa  98.6  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
275 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  27.54 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  28.39 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  27.12 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  26.27 
 
 
237 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  24.9 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
253 aa  92  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
266 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.32 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
243 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
299 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  24.62 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  27.31 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  22.99 
 
 
281 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
391 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  27.8 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  23.05 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  28.64 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.39 
 
 
558 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
270 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  26.27 
 
 
241 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  25.58 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.7 
 
 
265 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  28.06 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  26.7 
 
 
240 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0023  pimeloyl-CoA synthesis (biotin biosynthesis)  27.64 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00488591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  23.93 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>