More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3879 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  99.61 
 
 		 256 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  98.83 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  98.75 
 
 		 240 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  80.47 
 
 		 256 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  79.69 
 
 		 256 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  80.08 
 
 		 256 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  79.69 
 
 		 256 aa  434  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  79.69 
 
 		 256 aa  434  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  79.69 
 
 		 256 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  79.69 
 
 		 256 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  79.69 
 
 		 256 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  79.3 
 
 		 256 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  78.26 
 
 		 257 aa  424  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  70.24 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  68.63 
 
 		 255 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  68.63 
 
 		 255 aa  363  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  65.87 
 
 		 258 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  65.87 
 
 		 258 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  65.87 
 
 		 258 aa  360  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  63.97 
 
 		 261 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  65.48 
 
 		 259 aa  341  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  50.81 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  49.4 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  50.62 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  48.57 
 
 		 254 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  48.03 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  47.68 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  47.68 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  47.13 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  46.84 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  47.13 
 
 		 264 aa  224  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  45.95 
 
 		 268 aa  224  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  45.31 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  46.81 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  47.03 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  43.72 
 
 		 264 aa  221  8e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  45.71 
 
 		 260 aa  221  8e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  46 
 
 		 260 aa  218  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  45.61 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  45.11 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  47.44 
 
 		 230 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  43.39 
 
 		 253 aa  204  8e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  40.08 
 
 		 269 aa  195  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  40.89 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  34.54 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  40.16 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  43.1 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39.92 
 
 		 275 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  37.96 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  37.14 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  34.85 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  34.41 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  35.29 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  32.8 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  38.16 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  36.63 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  34.47 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39.47 
 
 		 246 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  41.6 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  41.6 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.91 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 270 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  30.21 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  30.21 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  31.38 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  30.58 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  28.52 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  33.66 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  31.9 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  31.03 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  33.17 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  29.74 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  31.03 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 275 aa  92.4  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  28.33 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.63 
 
 		 558 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.91 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.92 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1165  alpha/beta hydrolase  29.83 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  31.22 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  29.41 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  24.56 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1897  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.595115  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>