More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0217 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  100 
 
 		 273 aa  557  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  43.09 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  43.5 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  43.5 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  42.46 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  42.06 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  43.2 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  42.62 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  41.67 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  42.06 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  42.06 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  42.06 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  42.06 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  42.06 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  42.06 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  42.13 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  39.44 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  39.44 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  39.44 
 
 		 258 aa  195  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  42.52 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  43.78 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  42.17 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  40 
 
 		 269 aa  191  9e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  42.28 
 
 		 264 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  42.68 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  39.38 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  42.23 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  41.87 
 
 		 264 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  41.06 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  41.49 
 
 		 261 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  40.24 
 
 		 257 aa  188  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  40.16 
 
 		 256 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  40.16 
 
 		 256 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  40.16 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  39.04 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  39.34 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  39.75 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  40.16 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  39.51 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  40.33 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  41.84 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  40.59 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  40.34 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  42.15 
 
 		 230 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  38.55 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  36.9 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  39.5 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  35.22 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  33.2 
 
 		 239 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  34.29 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  33.21 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  32.79 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  33.47 
 
 		 255 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  31.28 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  34.16 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  30.34 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  30.92 
 
 		 246 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  34.96 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  28.4 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  30.29 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  30.28 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  32.67 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  32.67 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.8 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  28.57 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  28.57 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  26.37 
 
 		 558 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  28.26 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  27.83 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  28.75 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  26.94 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  27.39 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  28.57 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  24.81 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  27.59 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  25 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  21.29 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  27.71 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  24.59 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.93 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  28.38 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  23.93 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  24.71 
 
 		 272 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 272 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  27.04 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>