More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3806 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  100 
 
 		 264 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  95.83 
 
 		 264 aa  517  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  94.32 
 
 		 264 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  90.87 
 
 		 230 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  78.85 
 
 		 264 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  79.23 
 
 		 264 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  78.85 
 
 		 264 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  79.24 
 
 		 240 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  80.08 
 
 		 240 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  70.47 
 
 		 256 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  66.67 
 
 		 264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  62.45 
 
 		 260 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  65.23 
 
 		 260 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  64.17 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  63.75 
 
 		 255 aa  327  9e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  57.03 
 
 		 268 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  48.22 
 
 		 261 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  47.13 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  47.13 
 
 		 256 aa  222  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  47.03 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  47.03 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  47.13 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  47.13 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  47.13 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  47.13 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  47.03 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  45.31 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  47.13 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  46.38 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  46.61 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  48.12 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  46.72 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  46.8 
 
 		 258 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  46.75 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  47.22 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  45.53 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  45.91 
 
 		 254 aa  211  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  46.56 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  44.96 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  42.8 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  42.8 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  42.8 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  44.73 
 
 		 255 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  45.04 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  47.18 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  42.28 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  38.89 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  40.86 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  40.31 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39.08 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  37.98 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  39.76 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  40 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  31.78 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  32.67 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  33.06 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  32.14 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  32.81 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  36.1 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.57 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  30.24 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  31.82 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  32.1 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  32.1 
 
 		 240 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  30.65 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  29.84 
 
 		 243 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  30.08 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  35.2 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  35.2 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  28.63 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  31.15 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  28.63 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  30.17 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  31.36 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  26.96 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.95 
 
 		 558 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  26.96 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8659  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.77 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.37 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1165  alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.23 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.8 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>