More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3505 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  66.93 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  66.54 
 
 		 264 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  66.54 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  63.49 
 
 		 264 aa  345  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  65.25 
 
 		 264 aa  346  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  66.8 
 
 		 264 aa  345  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  62.99 
 
 		 256 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  65.23 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  69.07 
 
 		 240 aa  331  6e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  63.64 
 
 		 259 aa  323  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  66.1 
 
 		 240 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  61.26 
 
 		 255 aa  315  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  55.38 
 
 		 260 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  65.5 
 
 		 230 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  49.62 
 
 		 268 aa  271  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  50.41 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  50.2 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  49.17 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  49.17 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  49.17 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  49.17 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  48.57 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  49.17 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  46.61 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  48.75 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  47.81 
 
 		 254 aa  223  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  46.8 
 
 		 261 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  45.71 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  45.71 
 
 		 256 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  44.8 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  48.13 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  45.71 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  47.35 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  46.31 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  44.9 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  45.11 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  45.12 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  46.25 
 
 		 261 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  45.34 
 
 		 268 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  43.33 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  43.33 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  43.33 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  44.84 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  41.06 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  39.2 
 
 		 259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  41.67 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  38.82 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  35.06 
 
 		 239 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  39 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  34.66 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  36.43 
 
 		 255 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  36.82 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  33.46 
 
 		 263 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  38.49 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  36.36 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  36.25 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  31.97 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  34.31 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  35.95 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.78 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  31.2 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  31.02 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  30.61 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  28.98 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  29.39 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  35.29 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  35.29 
 
 		 254 aa  92.8  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 266 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  32.37 
 
 		 240 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  28.57 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  29.44 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  28.57 
 
 		 234 aa  90.5  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.71 
 
 		 558 aa  90.5  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  28.81 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  31.43 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.63 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  27.01 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  30.3 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  31.6 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  24.24 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4186  bioH protein, putative  23.27 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>