More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4331 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  99.24 
 
 
264 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  98.86 
 
 
264 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  97.08 
 
 
240 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  78.85 
 
 
264 aa  429  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  79.23 
 
 
264 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  79.23 
 
 
264 aa  424  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  82.92 
 
 
240 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  67.05 
 
 
264 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  79.56 
 
 
230 aa  371  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  69.72 
 
 
256 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  64.86 
 
 
260 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  66.54 
 
 
260 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  64.84 
 
 
255 aa  345  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  65.22 
 
 
259 aa  337  8e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  55.77 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  50.2 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  50.4 
 
 
254 aa  230  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  48.03 
 
 
261 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  46.8 
 
 
256 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  46.4 
 
 
256 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  46.4 
 
 
256 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  46.4 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  46.84 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  46.4 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  46.84 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  46.4 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  46.4 
 
 
256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  46.8 
 
 
256 aa  224  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  46.84 
 
 
256 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  46.4 
 
 
256 aa  224  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  46.61 
 
 
240 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  45.99 
 
 
256 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  45.85 
 
 
264 aa  221  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  49.58 
 
 
257 aa  220  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  46.53 
 
 
268 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  46.06 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  44.44 
 
 
258 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  44.44 
 
 
258 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  44.44 
 
 
258 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  45.16 
 
 
255 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  45.35 
 
 
269 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  45.6 
 
 
261 aa  209  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  44.94 
 
 
259 aa  208  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  44.98 
 
 
255 aa  208  8e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  43.09 
 
 
273 aa  201  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  40.57 
 
 
259 aa  192  6e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  40.62 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  42.41 
 
 
259 aa  171  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  39.84 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  38.93 
 
 
275 aa  168  9e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  38.49 
 
 
266 aa  161  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  40.94 
 
 
255 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  34.15 
 
 
239 aa  145  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  33.74 
 
 
239 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  34.51 
 
 
263 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  33.74 
 
 
253 aa  137  1e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  33.33 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  39.32 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  36.21 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  35.46 
 
 
277 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.64 
 
 
237 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  33.07 
 
 
266 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  31.49 
 
 
243 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  31.91 
 
 
243 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
253 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  32.34 
 
 
243 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  31.06 
 
 
243 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
270 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  32.16 
 
 
240 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  32.16 
 
 
240 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
266 aa  94  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  33.07 
 
 
254 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  33.07 
 
 
254 aa  92  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  27.5 
 
 
234 aa  92  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  27.5 
 
 
234 aa  92  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  29.31 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  30.6 
 
 
243 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  29.67 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
275 aa  87.8  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  27.91 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
272 aa  86.3  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
271 aa  86.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
270 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  31.47 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  31.03 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  34.78 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  27.75 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  26.69 
 
 
273 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1165  alpha/beta hydrolase  29.24 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  24.26 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
271 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  30.05 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>