More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0242 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  100 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  62.07 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  56.39 
 
 		 264 aa  315  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  56.6 
 
 		 264 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  57.03 
 
 		 264 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  57.63 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  56.77 
 
 		 255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  56.82 
 
 		 256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  55.98 
 
 		 264 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  55.98 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  55.77 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  58.13 
 
 		 240 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  55.28 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  56.07 
 
 		 230 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  51.67 
 
 		 259 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  49.62 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  49.03 
 
 		 257 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  45.56 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  45.95 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  45.95 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  45.95 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  45.56 
 
 		 256 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  46.9 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  46.9 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  46.9 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  46.9 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  46.9 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  46.12 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  46.9 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  46.64 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  46.4 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  44.62 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  44.49 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  44.49 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  44.49 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  46.51 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  45.14 
 
 		 264 aa  218  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  44.4 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  42.38 
 
 		 259 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  44.31 
 
 		 261 aa  211  7e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  40.75 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  43.31 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  42.91 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  41.86 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  39.38 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  43.35 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  37.16 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  35.83 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  35.43 
 
 		 239 aa  155  8e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  38.55 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  33.85 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  35.83 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  33.46 
 
 		 255 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  34.12 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  32.71 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  33.86 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  32.03 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  29.85 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  34.57 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.13 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  36.4 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  36.4 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  29.1 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  31.47 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 243 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  27.2 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  28.51 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  28.75 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  29.39 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  27.92 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  28.81 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  28.51 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  27.69 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  27.52 
 
 		 558 aa  87  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  26.4 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  26.4 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  27.92 
 
 		 243 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  31.51 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  29.13 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  27.95 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.52 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.63 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  19.92 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 504 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>