99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06000 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  100 
 
 		 240 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  53.94 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  55.19 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  54.77 
 
 		 243 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  53.11 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  55.83 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  54.17 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  61.44 
 
 		 241 aa  223  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  53.33 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  52.92 
 
 		 240 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  52.08 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  33.62 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  33.74 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  32.92 
 
 		 255 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  32.92 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  32 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  30.96 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.61 
 
 		 558 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  37.05 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.98 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  28.63 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  28.11 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  33.16 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  29.17 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  31.56 
 
 		 264 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  31.15 
 
 		 264 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  31.87 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  31.47 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  29.71 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  32.16 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  31.47 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  31.47 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  30.56 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  29.46 
 
 		 259 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  29.05 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  31.28 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  26.34 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  33.74 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  29.13 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  31.79 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  29.46 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  27.98 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  27.98 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  27.05 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  27.98 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  28.06 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  23.85 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  30.3 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  28.12 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  28.63 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  28.63 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  28.63 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  28.63 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  28.22 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  28.63 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  28.63 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  29.41 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  29.41 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  29.41 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  29.41 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  37.55 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  28.57 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  29.46 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  29.78 
 
 		 230 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  29.24 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  28.8 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  28.57 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  30.2 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  29.1 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  29.44 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  31.09 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  24.78 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  20.9 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  33.7 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  22.65 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3873  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.627652  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  22.65 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.63 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3789  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0032  biotin synthesis protein BioH  25.7 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  25.42 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  25.7 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0961  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0214674  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  26.23 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.79 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  31.87 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1664  polyketide synthase, putative  27.2 
 
 		 2082 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.685154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  20.43 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2992  hypothetical protein  30.4 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289546  hitchhiker  0.00544099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3767  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 		 296 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1108  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>