29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0032 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0032  biotin synthesis protein BioH  100 
 
 
232 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0143  hypothetical protein  37.83 
 
 
222 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0432304 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  24.9 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  24.9 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  25.7 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  25.29 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  23.75 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  28.91 
 
 
275 aa  49.7  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0614  hypothetical protein  22.97 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  22.92 
 
 
239 aa  48.9  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3948  alpha/beta hydrolase fold  21.99 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4250  putative bioH protein  21.99 
 
 
246 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3872  biotin biosynthesis protein (BioH)  21.16 
 
 
246 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  26.82 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
266 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  27.04 
 
 
243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  26.53 
 
 
243 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4140  putative bioH protein  20.75 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4338  biotin biosynthesis protein BioH  20.75 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3858  biotin biosynthesis protein (BioH)  20.75 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4025  bioH protein  20.75 
 
 
246 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  26.53 
 
 
243 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  24.7 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  26.69 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  25.48 
 
 
258 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  25.48 
 
 
258 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  25.48 
 
 
258 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>