More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3708 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  98.75 
 
 
256 aa  487  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  98.75 
 
 
256 aa  487  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  98.33 
 
 
256 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  97.5 
 
 
256 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  80.42 
 
 
256 aa  408  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  79.58 
 
 
256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  80 
 
 
256 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  79.58 
 
 
256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  79.58 
 
 
256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  79.58 
 
 
256 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  79.58 
 
 
256 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  79.17 
 
 
256 aa  400  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  79.58 
 
 
256 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  78.9 
 
 
257 aa  397  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  70.34 
 
 
264 aa  351  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  68.62 
 
 
255 aa  345  4e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  68.62 
 
 
255 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  65.68 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  65.68 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  65.68 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  65.68 
 
 
259 aa  319  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  63.64 
 
 
261 aa  317  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  51.07 
 
 
261 aa  254  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  49.16 
 
 
268 aa  247  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  49.13 
 
 
254 aa  236  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  49.13 
 
 
261 aa  235  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  48.36 
 
 
259 aa  231  6e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  46.61 
 
 
264 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  46.61 
 
 
264 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  46.61 
 
 
264 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  46.38 
 
 
240 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  46.38 
 
 
264 aa  221  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  46.38 
 
 
264 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  46.38 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  46.4 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  45.11 
 
 
256 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  44.73 
 
 
264 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  46.29 
 
 
255 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  47.08 
 
 
260 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  45.11 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  45.11 
 
 
240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  46.61 
 
 
230 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  42.74 
 
 
253 aa  201  7e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  39.91 
 
 
269 aa  189  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  40.51 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  34.32 
 
 
259 aa  184  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  39.51 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  41.56 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  38.43 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  36.89 
 
 
255 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  36.07 
 
 
255 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  33.91 
 
 
239 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  33.91 
 
 
239 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  35.71 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  32.22 
 
 
263 aa  138  8.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  37 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  35.27 
 
 
259 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  33.78 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  38.77 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  40.83 
 
 
254 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  40.83 
 
 
254 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
277 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.61 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 
270 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  29.49 
 
 
234 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  29.49 
 
 
234 aa  101  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  30.8 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  30.42 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  35.12 
 
 
243 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  27.98 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  30.3 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  29.57 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  30.3 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  28.51 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.22 
 
 
558 aa  89  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  32 
 
 
240 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  31.5 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.19 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.39 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  28.94 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1165  alpha/beta hydrolase  28.69 
 
 
251 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  28.38 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.21 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  29.24 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  29.65 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  23.79 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  26.07 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  23.23 
 
 
277 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>