More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1980 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  37.4 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  33.88 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  32.53 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  35.34 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  32.79 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  34.52 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  32.81 
 
 		 266 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  32.78 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  32.78 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  32.78 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  33.6 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  33.47 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  32.64 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  32.93 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  32.78 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  32.65 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  33.74 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  33.06 
 
 		 256 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  33.06 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  33.06 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  33.06 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  33.06 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  33.47 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  33.06 
 
 		 256 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  31.84 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  33.47 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  33.74 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  35.46 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  35.46 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  32.92 
 
 		 261 aa  132  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  30.4 
 
 		 264 aa  132  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  30.83 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  33.19 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  29.8 
 
 		 258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  29.8 
 
 		 258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  29.8 
 
 		 258 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  35.06 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  31.3 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  34.98 
 
 		 240 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  31.6 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  32.38 
 
 		 264 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  30.65 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  32.28 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  31.65 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  31.11 
 
 		 259 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  33.2 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  32.59 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  34.14 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  33.6 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  32.96 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  32.68 
 
 		 264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  34.98 
 
 		 247 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  31.43 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.13 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  30.74 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  29.79 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  31.02 
 
 		 239 aa  117  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  26.3 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  35.4 
 
 		 230 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  32.17 
 
 		 558 aa  112  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  33.79 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  31.5 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  32.11 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.49 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  32.23 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  32.23 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  33.51 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  32.2 
 
 		 243 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  27.78 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  30.92 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  31.37 
 
 		 240 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  31.85 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  32.47 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  30.73 
 
 		 243 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  31.22 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  31.44 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  30.73 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  25.2 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  28.46 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  28.46 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.67 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  24.19 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  25.2 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  29.18 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.518334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  22.43 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  24.5 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  24.9 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  24.42 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>