More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00616 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  88.14 
 
 		 261 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  71.54 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  60.71 
 
 		 261 aa  334  9e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  55.16 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  55.2 
 
 		 255 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  52.17 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  53.06 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  53.06 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  53.06 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  53.06 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  52.65 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  53.06 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  52.65 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  52.65 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  51.98 
 
 		 261 aa  258  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  53.78 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  52.05 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  52.87 
 
 		 257 aa  250  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  49.4 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  49.4 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  49.4 
 
 		 258 aa  248  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  48.57 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  48.57 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  48.57 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  48.57 
 
 		 256 aa  245  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  49.13 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  48.56 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  50.4 
 
 		 264 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  50.4 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  50.4 
 
 		 264 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  44.49 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  47.13 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  47.81 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  46.96 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  46.48 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  46.09 
 
 		 264 aa  214  8e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  48.7 
 
 		 240 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  39.76 
 
 		 259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  45.91 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  45.31 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  48.52 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  45.12 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  42.91 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  41.7 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  46.45 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  40.59 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  42.86 
 
 		 255 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  37.65 
 
 		 254 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  37.89 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  33.33 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  34.35 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  33.33 
 
 		 239 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  35.83 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  36.25 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  36.69 
 
 		 255 aa  154  9e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  35.89 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  37.04 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  37.19 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  38.7 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  31.03 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 266 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  33.74 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  31.93 
 
 		 237 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  36.21 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  36.21 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  32.23 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  31.82 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  32.47 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  32.23 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.69 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  29 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  31.17 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  26.03 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  26.03 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  32.52 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  30.04 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  30.04 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  28.22 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4086  carboxylesterase  33.47 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  29.17 
 
 		 240 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 		 277 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30 
 
 		 558 aa  85.5  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2815  carboxylesterase  26.75 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02640  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.42 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0973655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>