More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3630 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3630  bioH protein  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0156  bioH protein  65.61 
 
 		 256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0176  carboxylesterase  64.59 
 
 		 264 aa  351  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4010  bioH protein  65.35 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3882  bioH protein  65.35 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4127  bioH protein  65.61 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  65.61 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4331  bioH protein  65.22 
 
 		 264 aa  337  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3806  bioH protein  64.17 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.1902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  63.64 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0140  bioH protein  66.53 
 
 		 240 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3801  bioH protein  65.25 
 
 		 240 aa  318  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4013  bioH protein  61.02 
 
 		 255 aa  308  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4626  bioH protein  63.64 
 
 		 230 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3530  bioH protein  55.91 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0242  bioH protein  51.67 
 
 		 268 aa  280  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  48.03 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  48.03 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3711  carboxylesterase BioH  48.03 
 
 		 256 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  47.64 
 
 		 256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3708  carboxylesterase BioH  48.36 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  48.56 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  48.15 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3825  bioH protein  48.18 
 
 		 257 aa  225  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  48.15 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  48.15 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  48.15 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  48.15 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  48.15 
 
 		 256 aa  224  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  46.67 
 
 		 255 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3887  carboxylesterase BioH  48.15 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.840174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4719  carboxylesterase BioH  48.55 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0199  carboxylesterase BioH  44.27 
 
 		 261 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  46.64 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  46.4 
 
 		 261 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  44.71 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2290  bioH protein  46.4 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  43.72 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  45.9 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  45.31 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  46.64 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4230  bioH protein  44.98 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.763657  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  41.94 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  41.94 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  41.94 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  42.17 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3200  bioH protein  37.74 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.111327  normal  0.0170475 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  34.52 
 
 		 239 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  34.13 
 
 		 239 aa  165  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0627  bioH protein  35.8 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  38.28 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0709  biotin biosynthesis protein  35.02 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  33.59 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  34.38 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  35.16 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0485  bioH protein  33.47 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.361568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03628  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  34.5 
 
 		 275 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1127  BioH protein  33.75 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2898  alpha/beta fold hydrolase  32.13 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0883577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0321  BioH  35.68 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.026043 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1042  carboxylesterase  28.81 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.763205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0935  putative carboxylesterase BioH  28.81 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  36.72 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  36.72 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4838  carboxylesterase  31.05 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.665163 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1980  Alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.3 
 
 		 270 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0364  carboxylesterase  31.05 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  33.33 
 
 		 266 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0390  carboxylesterase  31.05 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.968879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0394  carboxylesterase  31.05 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307136  normal  0.471303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3014  putative pimeloyl-BioC--CoA transferase BioH  33.04 
 
 		 246 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0602  putative biotin biosynthesis protein bioH  33 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5174  Alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152016  normal  0.266185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06530  putative biotin biosynthesis protein bioH  33 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0496  bioH protein  30.08 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4685  bioH protein  28.92 
 
 		 243 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2434  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3455  carboxylesterase  28.36 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06000  biotin biosynthesis protein BioH  29.46 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1704  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.15 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0156  Carboxylesterase  33.82 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  29.28 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.54 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  25.77 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.15 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  25.77 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  25.77 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>