More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0874 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
301 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  58.61 
 
 
305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  34.57 
 
 
269 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 
269 aa  201  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4896  hydrolase, alpha/beta fold family  37.08 
 
 
269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4511  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  36.33 
 
 
269 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  36.7 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  36.33 
 
 
269 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4897  hydrolase, alpha/beta fold family  36.33 
 
 
269 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4530  alpha/beta fold family non-heme chloroperoxidase  36.33 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00926815  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4929  alpha/beta fold family hydrolase  36.33 
 
 
269 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4670  alpha/beta fold family hydrolase  36.33 
 
 
269 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5030  alpha/beta fold family hydrolase  36.33 
 
 
269 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1575  alpha/beta hydrolase fold protein  37.45 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1659  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
270 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00584472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  34.44 
 
 
273 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0256  alpha/beta hydrolase fold protein  36.02 
 
 
292 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.022774  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  34.33 
 
 
272 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
273 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3133  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
273 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6365  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
273 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0929699  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 
272 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
272 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
272 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 
297 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5467  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
273 aa  158  9e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
272 aa  158  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
272 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  30.71 
 
 
272 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  32.08 
 
 
272 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
273 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
273 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
273 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  32.95 
 
 
276 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
279 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  35.56 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  35.56 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3165  bromoperoxidase  35.56 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0230592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  35.56 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  34.81 
 
 
278 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
278 aa  146  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  34.81 
 
 
278 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  34.46 
 
 
278 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
286 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0387  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
269 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 
278 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
281 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 
277 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 
273 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
278 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3084  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 
235 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
281 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1384  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.291568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  28.94 
 
 
322 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
286 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  32.05 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.62 
 
 
273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  26.94 
 
 
273 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
277 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
277 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
275 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  27.14 
 
 
274 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
277 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
338 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1162  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
274 aa  124  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
278 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
294 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
273 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
269 aa  123  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2331  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
274 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0600878  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
317 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  24.72 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3320  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  27.72 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06620  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.85 
 
 
281 aa  119  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.270497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
271 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  28.68 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4179  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3969  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2040  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
264 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 
276 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
278 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>