More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5072 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
281 aa  569  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  39.52 
 
 
261 aa  155  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  38.98 
 
 
261 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  39.84 
 
 
261 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  39.84 
 
 
261 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  37.02 
 
 
264 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  39.84 
 
 
261 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  39.52 
 
 
261 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  37.4 
 
 
261 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  38.62 
 
 
261 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  38.62 
 
 
261 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  38.62 
 
 
261 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  38.62 
 
 
261 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.62 
 
 
261 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  38.62 
 
 
261 aa  149  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  33.74 
 
 
373 aa  149  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.21 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  35.24 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  35.63 
 
 
268 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
279 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  33.2 
 
 
262 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  37.15 
 
 
266 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  33.6 
 
 
261 aa  142  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  34.08 
 
 
282 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  31.95 
 
 
260 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  31.95 
 
 
260 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  32.82 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  37.15 
 
 
397 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  35.27 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  33.21 
 
 
275 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  33.88 
 
 
279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  32.16 
 
 
265 aa  136  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  32.48 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  32.68 
 
 
260 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  35.71 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  35.38 
 
 
396 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  33.08 
 
 
269 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  34.41 
 
 
260 aa  132  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  32.13 
 
 
263 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
277 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  31.52 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  37.35 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  34.92 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  31.25 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  32.91 
 
 
277 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  35.89 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  33.46 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  31.91 
 
 
271 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  36.44 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  32.91 
 
 
292 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  33.59 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2245  3-oxoadipate enol-lactonase  34.66 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  34.51 
 
 
262 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  34.51 
 
 
262 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  34.84 
 
 
262 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  33.76 
 
 
386 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 
262 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  34.52 
 
 
265 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  35.52 
 
 
393 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
282 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
263 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.94 
 
 
277 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
269 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
275 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 
275 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  35.8 
 
 
256 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  32.25 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  34.41 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.85 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  33.47 
 
 
263 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
254 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  34.85 
 
 
256 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  34.85 
 
 
256 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  34.85 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  30.89 
 
 
259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  33.73 
 
 
265 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.03 
 
 
425 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 
255 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  29.34 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
260 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  32.9 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  31.78 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.44 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  35.68 
 
 
397 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  34.43 
 
 
251 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  31.95 
 
 
270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0302  carboxymuconolactone decarboxylase  33.47 
 
 
389 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0830882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.23 
 
 
263 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  32.16 
 
 
262 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  35.22 
 
 
393 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  34.75 
 
 
263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  32.27 
 
 
260 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 
256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  29.76 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>