More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5295 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 267 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  90.98 
 
 		 267 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  63.91 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  63.64 
 
 		 264 aa  352  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  59.92 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  59.54 
 
 		 263 aa  344  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 		 268 aa  341  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  60.23 
 
 		 273 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  58.94 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  59.47 
 
 		 273 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  59.54 
 
 		 269 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  58.02 
 
 		 268 aa  332  4e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  58.49 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  58.02 
 
 		 266 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  55.51 
 
 		 288 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  51.53 
 
 		 266 aa  294  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  53.36 
 
 		 274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  53.03 
 
 		 276 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  53.36 
 
 		 274 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  47.73 
 
 		 269 aa  285  5.999999999999999e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  48.86 
 
 		 270 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  47.89 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  45.59 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  48.72 
 
 		 245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  46.75 
 
 		 282 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  36.98 
 
 		 270 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  24.7 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4117  bioH protein  28.52 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.38 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  22.69 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  23.64 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  25.42 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4632  bioH protein  25.09 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3924  bioH protein  27.34 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.936  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0420  bioH protein  26.48 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0244  bioH protein  26.48 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.24 
 
 		 262 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0318  bioH protein  26.91 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.74 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.29 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.29 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  24.91 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  24.51 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.11 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  22.68 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 350 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  21.46 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0217  bioH protein  27.5 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.59691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3783  carboxylesterase BioH  24.81 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  23.79 
 
 		 288 aa  67  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3793  carboxylesterase BioH  24.81 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  29.31 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0301  bioH protein  24.32 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100907  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2099  biotin biosynthesis protein, BioH  25.76 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0236  bioH protein  24 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03264  carboxylesterase of pimeloyl-CoA synthesis  24.42 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0414554  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0301  carboxylesterase BioH  24.42 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.151878  normal  0.0475202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3693  carboxylesterase BioH  24.32 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03216  hypothetical protein  24.42 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0353415  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3609  carboxylesterase BioH  24.42 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  21.99 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3879  carboxylesterase BioH  24.81 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3817  carboxylesterase BioH  24.81 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.979411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>