More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0891 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
271 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  85.19 
 
 
271 aa  471  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  60.31 
 
 
260 aa  311  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 
256 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
258 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
299 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 
281 aa  97.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  32.26 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
260 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
280 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.51 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.84 
 
 
374 aa  92  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.23 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
270 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.92 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
263 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
275 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
277 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  26.95 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.87 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.4 
 
 
371 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
269 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2388  3-oxoadipate enol-lactonase  29.75 
 
 
386 aa  87  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
271 aa  86.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.69 
 
 
265 aa  86.3  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
268 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
280 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.63 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
270 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.29 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  32.05 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.89 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  27 
 
 
263 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 
263 aa  82  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
271 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  30.28 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  28.62 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
295 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.93 
 
 
372 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  31.65 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.85 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.74 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  27.12 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 
256 aa  79.3  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
268 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
340 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
340 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  29.05 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
256 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
256 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  30.08 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.69 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  25.49 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
265 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
285 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.53 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.53 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.42 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.98 
 
 
372 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 
261 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  26.43 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.77 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  26.32 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>