More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1822 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
267 aa  548  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  62.36 
 
 
268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  58.02 
 
 
245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 
287 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  42.75 
 
 
263 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  44.7 
 
 
276 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  44.74 
 
 
274 aa  258  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  45.11 
 
 
274 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  41.22 
 
 
288 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
270 aa  254  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  42.25 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  43.35 
 
 
263 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  41.29 
 
 
266 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  43.56 
 
 
267 aa  247  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  42.08 
 
 
272 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  43.18 
 
 
264 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  44.53 
 
 
267 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  42.64 
 
 
269 aa  238  9e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  44.02 
 
 
269 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
266 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
266 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  40.7 
 
 
266 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 
281 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 
267 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  42.64 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  40.6 
 
 
273 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
282 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  35.27 
 
 
268 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 
270 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.72 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.19 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  21.95 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  23.64 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  22.73 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  22.99 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  22.99 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  21.37 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.51 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  21.46 
 
 
271 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  22.78 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  23.11 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.31 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  22.08 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  22.51 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  24.08 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1820  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.65199  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.42 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  22.65 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  22.35 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  24.14 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  21.05 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2162  bioH protein  22.76 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  20.99 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  20.87 
 
 
279 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1663  alpha/beta hydrolase fold  21.46 
 
 
271 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  24.4 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  21.03 
 
 
263 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
333 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  22.85 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  21.03 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  23.75 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  24.4 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  22.18 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  21.92 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  21.77 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  23.46 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  23.74 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  23.02 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  20.49 
 
 
392 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  23.02 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2661  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  25.86 
 
 
277 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  21.09 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  21.99 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  20.71 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  20.17 
 
 
373 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  24.26 
 
 
260 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  20.22 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>