More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3813 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  67.3 
 
 		 263 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  69.2 
 
 		 272 aa  368  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  65.4 
 
 		 263 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  63.88 
 
 		 267 aa  360  9e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 		 267 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  63.26 
 
 		 267 aa  347  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  64.39 
 
 		 268 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  64.89 
 
 		 268 aa  335  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  62.36 
 
 		 288 aa  332  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  60.75 
 
 		 276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  59.92 
 
 		 266 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  58.71 
 
 		 274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  62.6 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  62.6 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  57.95 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  62.6 
 
 		 266 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  59.85 
 
 		 267 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  55.51 
 
 		 269 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  51.32 
 
 		 270 aa  288  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  49.62 
 
 		 269 aa  287  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  52.08 
 
 		 273 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  53.03 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  46.95 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  51.32 
 
 		 281 aa  254  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  52.49 
 
 		 282 aa  248  7e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  46.91 
 
 		 245 aa  238  6.999999999999999e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  43.18 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  39.25 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  41.31 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30.04 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.81 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  25.1 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1698  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 397 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.6 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  25.19 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.98 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  24.81 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6302  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.5 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.58 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  24.06 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  22.85 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.06 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.06 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  27.11 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.47 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.06 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  24.15 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.79 
 
 		 425 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  25.27 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  25.19 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 		 281 aa  68.9  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.4 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  27.27 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  27.68 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  24.32 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 278 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  23.42 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.76 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2691  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>