More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4363 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4363  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 282 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  76.81 
 
 		 281 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2854  alpha/beta hydrolase fold protein  54.68 
 
 		 276 aa  297  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  53.26 
 
 		 274 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  52.87 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3813  alpha/beta hydrolase fold protein  52.49 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.580817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  51.54 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0618  alpha/beta hydrolase fold protein  48.28 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3851  alpha/beta hydrolase fold protein  51.34 
 
 		 272 aa  257  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.827885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  49.61 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4078  alpha/beta hydrolase fold  47.73 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0620  alpha/beta hydrolase fold protein  47.51 
 
 		 263 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118573  normal  0.0593878 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  46.21 
 
 		 268 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3856  alpha/beta hydrolase fold  46.48 
 
 		 266 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.76945  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2922  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2892  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360305  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2936  alpha/beta hydrolase fold  49.24 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5295  alpha/beta hydrolase fold  46.75 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1312  putative hydrolase  45.38 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718757  normal  0.106288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  44.23 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1987  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01668  alpha/beta hydrolase  41.45 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  39.3 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2309  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.118678  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1604  hydrolase, putative  41.47 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.626551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3775  Alpha/beta hydrolase fold  41.47 
 
 		 273 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0763681  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5274  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5821  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.726094  decreased coverage  0.00151832 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.79 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.79 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  29.74 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.79 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  25 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  30.77 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.55 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.8 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.98 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.71 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.10927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001876  biotin synthesis protein BioH  25.57 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  27.78 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03993  putative bioH protein  27.6 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.39714  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00616  biotin biosynthesis protein BioH  26.09 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  27.13 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  26.46 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  24 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1430  biotin biosynthesis protein BioH  26.4 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  27.2 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.42 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  26.74 
 
 		 393 aa  72.4  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  28.09 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.48 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6446  putative Alpha/beta hydrolase, putative protoporphyrin IX magnesium chelatase bchO-like protein  29.1 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.606393 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  25.83 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  26.75 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1554  biotin biosynthesis protein BioH  25.69 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.56 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  28.37 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  25.47 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  29.23 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0275  magnesium-chelatase, BchO  29.19 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.522227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>