More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1230 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
261 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  64.86 
 
 
260 aa  339  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6064  alpha/beta hydrolase fold protein  60.62 
 
 
262 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02777  conserved hypothetical protein  37.66 
 
 
587 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630325  normal  0.204044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
269 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  30.86 
 
 
510 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 
262 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 
263 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
280 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
277 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
277 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
264 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26 
 
 
282 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
275 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  31.43 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  31.45 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  30.3 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
265 aa  89.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
253 aa  87  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
280 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.52 
 
 
286 aa  86.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
287 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  26.16 
 
 
277 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 
367 aa  85.1  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  29.57 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  25.65 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  28.57 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  27.71 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  24.02 
 
 
272 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
237 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  22.64 
 
 
263 aa  82  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  25.9 
 
 
271 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  29.96 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.73 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.75 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.02 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.35 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  27.76 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  29.96 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.86 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  26.95 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.63 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.86 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  25 
 
 
380 aa  79  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  31.17 
 
 
393 aa  79  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  26.67 
 
 
260 aa  79  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  26.56 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3725  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1307  alpha/beta hydrolase fold protein  31.35 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.365456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.85 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  24.69 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.08 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  29.5 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  26.4 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2443  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.752916  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  27.72 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  25.1 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
308 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.37 
 
 
371 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  29.02 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  30.13 
 
 
393 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>