More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0636 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
237 aa  477  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  44.08 
 
 
263 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  46.03 
 
 
265 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  34.69 
 
 
283 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  40.56 
 
 
254 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.42 
 
 
248 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 
264 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 
263 aa  148  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  39.84 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  30.74 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 
263 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  40.51 
 
 
245 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.59 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  36.48 
 
 
266 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
235 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
264 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
261 aa  135  5e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  34.71 
 
 
264 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  38.93 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
266 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  35.44 
 
 
265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  40.97 
 
 
231 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 
261 aa  125  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  33.76 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
264 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.82 
 
 
289 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
262 aa  108  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  36.73 
 
 
248 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
263 aa  99  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1738  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.44874  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 
261 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
234 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
279 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  32.2 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0874  putative hydrolase  30.51 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  31.82 
 
 
279 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  31.54 
 
 
263 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  28.63 
 
 
285 aa  90.1  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  29.06 
 
 
233 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  32.66 
 
 
271 aa  89  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
300 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
277 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.24 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  32.39 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
278 aa  87  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  29.88 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  31.72 
 
 
261 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
276 aa  86.7  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  31.54 
 
 
263 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  31.72 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  33.06 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  30.86 
 
 
397 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  32.16 
 
 
261 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
277 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  31.72 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  31.4 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  32.5 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  31.28 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3900  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.479584 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3138  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  30.96 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00175613  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  34.62 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.86 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  32.35 
 
 
261 aa  82  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.27 
 
 
274 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  31.69 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  33.71 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  35.18 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  30.96 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>