More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1149 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
265 aa  537  9.999999999999999e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  42.64 
 
 
265 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  38.31 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.83 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  38.4 
 
 
265 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
264 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  34.15 
 
 
283 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  39.83 
 
 
263 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
264 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  33.6 
 
 
264 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
266 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  32.65 
 
 
266 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  38.56 
 
 
263 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
263 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 
264 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  37.71 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  37.65 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
266 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.51 
 
 
289 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  36.02 
 
 
261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  29.75 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  35.44 
 
 
237 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 
263 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 
262 aa  123  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  31.1 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1326  alpha/beta hydrolase fold protein  33.08 
 
 
279 aa  118  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  35.22 
 
 
245 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  36.02 
 
 
248 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  32.23 
 
 
271 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  33.61 
 
 
259 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  33.88 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  32.24 
 
 
263 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
235 aa  106  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2426  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
267 aa  106  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6489  alpha/beta hydrolase fold  30.37 
 
 
274 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.802107 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  31.14 
 
 
275 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  31.4 
 
 
274 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  31.12 
 
 
239 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  28.97 
 
 
264 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5998  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
274 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.492767 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5633  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 
274 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6154  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
274 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  33.7 
 
 
239 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
279 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
273 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.8 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  28.35 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
299 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5888  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653505  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0986  prolyl aminopeptidase  31.5 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.298096  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  29.92 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
245 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  27.35 
 
 
268 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 
262 aa  94.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
270 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.53 
 
 
275 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  32.54 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  35.88 
 
 
234 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0031  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  29.72 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  28.79 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00059  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  31.65 
 
 
238 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0330214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0162  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.63 
 
 
274 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
256 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 
392 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
277 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.6 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  28.92 
 
 
261 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 
257 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  26.89 
 
 
257 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  26.89 
 
 
257 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  30.28 
 
 
270 aa  89  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
256 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
256 aa  89  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
292 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.34 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0510  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  27.69 
 
 
380 aa  88.2  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.84 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.8 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.32 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>